L’Agence BIO est un groupement d’intérêt public (GIP) en charge du développement et de la promotion et de l’agriculture biologique. Il s’oriente sur deux axes majeurs. D’une part un travail de réflexion, d’expertise et de proposition, au travers de commissions spécialisées. D’autre part, la gestion en propre de différents dossiers (notification en agriculture biologique des opérateurs, observatoire économique, communication).
L’arrêté du 12 novembre 2001 portant approbation de la convention constitutive de l’Agence BIO a été publié au J.O. le 17 novembre 2001. Ce GIP regroupe le ministère de l’Agriculture, de l’Alimentation, de la Pêche et des Affaires Rurales, le ministère de l’Ecologie et du Développement Durable, l’Assemblée permanente des chambres d’agriculture (APCA), la Fédération nationale d’agriculture biologique des régions de France (FNAB). Son fonctionnement repose sur deux instances, en premier lieu un grand conseil d’orientation, qui réunit l’ensemble des partenaires impliqués dans le développement de l’agriculture biologique française (administrations, offices agricoles, syndicats professionnels, instituts de recherche, organismes certificateurs, associations de consommateurs…). Il est régulièrement tenu informé de l’état d’avancement des travaux de l’Agence BIO et donne son avis sur les orientations prises en matière de développement et de promotion de l’agriculture biologique. D’autre part, un conseil d’administration resserré rassemblant les acteurs les plus directement impliqués, à savoir les pouvoirs publics (les deux ministères précédemment cités) et les structures professionnelles APCA et FNAB.